Le 11 avril 2014, la Médiatrice européenne, Emily O'Reilly, a demandé à la Commission européenne de publier des lettres et des notes internes concernant la démission de l'ancien commissaire John Dalli en octobre 2012, une affaire sur laquelle  l’eurodéputé José Bové était longuement intervenu à l’occasion d’une conférence qu’il a tenu à Luxembourg en février 2014. La Médiatrice a inspecté les documents dans le cadre de son enquête pour une plainte d'une ONG dont la demande d'accès à ces documents a été refusée par la Commission.

"Les arguments de la Commission justifiant le refus d'accès ne sont pas convaincants. La divulgation des documents permettrait de rassurer le grand public sur le fait que la Commission a traité très sérieusement ce cas et de montrer un exemple de transparence pour de futurs cas d'intérêt public", a déclaré Emily O’Reilly.

En janvier 2013, l'ONG Corporate Europe Observatory a adressé une plainte à la Médiatrice au sujet du refus de la Commission de publier deux lettres de l'ancien commissaire Dalli au président de la Commission José Manuel Barroso et deux notes internes concernant les réunions entre M. Barroso et M. Dalli.

La Commission a expliqué son refus par la nécessité de protéger l'enquête des autorités maltaises et de ses propres opérations de suivi.

La Médiatrice a inspecté les documents et a conclu que les arguments de la Commission ne sont pas convaincants. Les documents n'ont pas été transmis aux autorités maltaises pour être versés comme preuve dans le dossier de leur enquête et ils ne contiennent aucune information qui ne relève déjà du domaine public. La Médiatrice a conclu que la Commission n'a pas justifié en quoi la divulgation des documents aurait miné l'enquête des autorités maltaises et ses propres actions de suivi. La Commission doit répondre au plus tard le 31 juillet 2014.